يجب تنظيف الأدوات الجراحية والبياضات (مثل الشاش والعباءات الجراحية ومناشف الجرح). يجب تنظيف الأدوات الجراحية التي تستخدم لمرة واحدة باستخدام اليدين أو بمنظفات الموجات فوق الصوتية قدر الإمكان بعد العملية. يجب تعبئة العناصر التي يتم تعقيمها بالبخار عالي الضغط أو بطرق أخرى (مثل أكسيد الإيثيلين) بطريقة خاصة. التعبئة لتقوية تأثير التعقيم وتخزين العناصر المعقمة.

قبل مجموعات جراحية يمكن التخلص منها معبأة ، يجب وضع الأدوات بشكل منفصل بالترتيب الذي يستخدمه الجراح. في حالة استخدام التعقيم بالبخار أو الغاز ، استخدم عبوة متينة وناعمة يمكن اختراقها بالبخار أو الغاز ولا يمكنها اختراق الكائنات الدقيقة.

عندما يتم تعقيم العبوة الجراحية التي تستخدم لمرة واحدة بالبخار أو الغاز ، من أجل ضمان اختراق أكبر للغاز ، يجب اتباع إرشادات خاصة. يتم تغليف العبوة المستخدمة في التعقيم بالبخار بطبقتين سميكتين من القماش القطني الناعم أو مادة غير محبوكة (أي الورق) قبل التعقيم. العبوات (العبوات المستخدمة مباشرة بعد التعقيم تحتاج إلى تبريد مناسب) يجب تغطيتها بمواد عازلة للحرارة ومقاومة للماء. هذا ليس ضروريًا إذا تم استخدامها في غضون 24 ساعة بعد التعقيم. يمكن تغليف الأشياء الصغيرة بورق عازل أو أكياس بلاستيكية قابلة للغلق. عند استخدام تعقيم الغاز ، يتم تعبئته بكيس بلاستيكي عازل للحرارة أو أنبوب أو قطعة قماش قطنية. عند استخدام البلازما في التعقيم ، يجب تغليفها في كيس من البولي بروبيلين أو كيس من البولي بروبيلين مختوم ومعزول بالحرارة.